Aminozuur
Uit Wikipedia, de vrije encyclopedie
Een aminozuur is een organische verbinding die zowel een carboxylgroep (-COOH) als een aminegroep (-NH2) bezit.
Inhoud |
[bewerk] Formule
De algemene formule voor een α-aminozuur is R-CH(NH2)-COOH.
R | H2N-Cα-COOH | H
R-Groep staat voor: Residu-groep, een groep die er eventueel aan kan zitten en in de tabel rechts wordt weergegeven. Dergelijke moleculen bezitten dus aan beide uiteinden groepen die met de groepen van andere aminozuren kunnen reageren.
Hierbij reageert de carboxyl-groep met de amine-groep en vormt onder afsplitsing van water (condensatiereactie) een peptidebinding. De verbinding die dan is ontstaan heet een amide. De nieuwe verbinding heeft weer een carboxyl- en een amine-groep.
Dit opent de mogelijkheid om een keten (polymeer) van aminozuren te maken met behulp van herhaalde 'kop' - 'staart' - reacties. Zo'n molecuul heet een peptide, en afhankelijk van het aantal betrokken aminozuren heten ze mono-, di-, tripeptiden, et cetera. Eiwitten zijn polypeptiden en vormen een groot deel van de chemische machinerie van de cel. Zij worden voor allerlei doeleinden gebruikt.
In de natuur komen een kleine honderd verschillende aminozuren voor. Aminozuren zijn vooral bekend als bouwsteen voor eiwitten en polypeptiden. Eiwitten worden opgebouwd uit twintig verschillende 'bouwstenen' die dan in de wandelgangen de 'twintig aminozuren' heten, hoewel niet alle twintig ook echt aminozuren zijn. Micro-organismen en planten maken vaak ook andere dan deze eiwit-aminozuren aan, zoals die in nisine en alamethicinine voorkomen. Nisine wordt gebruikt als conserveermiddel.
Voor de mens is er een aantal essentiële aminozuren. Dit zijn aminozuren, die de mens niet zelf vanuit de andere aminozuren kan maken en die via het voedsel moeten worden opgenomen. De andere kunnen in principe wel zelf gemaakt worden, hetzij uit de andere aminozuren, hetzij uit andere bouwstoffen.
Aminozuren in een eiwit kunnen op diverse manieren bepaald worden.
Daartoe wordt het eiwit eerst in brokstukken opgesplitst. Dit kan gebeuren door zure hydrolyse van het eiwit in 6 N zoutzuur bij verhoogde temperatuur. daarna worden de brokstukken van elkaar gescheiden met behulp van hoge druk vloeistofchromatografie (HPLC), gekleurd met ninhydrine kleuring en gedetecteerd bij 440 (proline) en 570 nm. Deze methode is bekend onder de naam Moore&Stein zure hydrolyse van eiwitten. De brokstukken kunnen ook gescheiden worden door middel van elektroforese.
[bewerk] Overzicht
Hier volgt een tabel met de 20 standaard aminozuren, en hun primaire eigenschappen:
De "twintig aminozuren" die in eiwitten voorkomen
(eventuele modificaties niet inbegrepen) |
|||||
---|---|---|---|---|---|
Naam | 3-Code | 1-Code | Essentieel | Lading bij pH=7 | R = |
Alanine | Ala | A | apolair | -CH3 | |
Arginine | Arg | R |
|
positief | -CH2-CH2-CH2-HN-(HN)=C(NH2) |
Asparagine | Asn | N | neutraal | -CH2-CO-NH2 | |
Asparaginezuur | Asp | D | negatief | -CH2-COOH | |
Cysteïne | Cys | C |
|
neutraal | -CH2-SH |
Fenylalanine | Phe | F |
|
apolair | -CH2-Ph |
Glutamine | Gln | Q | neutraal | -CH2-CH2-CO-NH2 | |
Glutaminezuur | Glu | E | negatief | -CH2-CH2-COOH | |
Glycine | Gly | G | apolair | -H | |
Histidine | His | H |
|
positief | -CH2-cycl(C=CH-N=CH-NH) |
Isoleucine | Ile | I |
|
apolair | -CH-(CH3)-CH2CH3 |
Leucine | Leu | L |
|
apolair | -CH2-CH-(CH3)2 |
Lysine | Lys | K |
|
positief | -CH2-CH2-CH2-CH2-NH2 |
Methionine | Met | M |
|
apolair | -CH2-CH2-S-CH3 |
Proline | Pro | P | apolair | -[5 ring van 4 C atomen en de amino-N die daardoor NH wordt] |
|
Serine | Ser | S | positief | -CH2-OH | |
Threonine | Thr | T |
|
postief | -CH(OH)-CH3 |
Tryptofaan | Trp | W |
|
apolair | -CH2-cyclo(Ph-NH-CH=C) |
Tyrosine | Tyr | Y |
|
positief | -CH2-p-Ph-OH |
Valine | Val | V |
|
apolair | -CH-(CH3)2 |
S = semi-essentieel (essentieel voor premature baby's en zieke volwassenen), K = alleen essentieel voor jonge kinderen |
[bewerk] Typen aminozuren
- α-aminozuren, waarbij de carboxyl- en aminogroep aan hetzelfde koolstofatoom zitten,
- β-aminozuren, waarbij de carboxyl- en aminogroep aan naast elkaar gelegen koolstofatomen zitten
- γ-aminozuren, waarbij de carboxyl- en aminogroep door drie koolstofatomen van elkaar gescheiden zijn.
- ω-aminozuren, waarbij de carboxyl- en aminogroep aan de uiteinden van (lange) koolstofketens zitten. Deze worden gebruikt voor het maken van polyamiden.
Bij alle biologisch belangrijke aminozuren zit de amino- en de carboxylgroep vast aan hetzelfde koolstofatoom, zodat ze allemaal met de algemene formule R-CH(NH2)-COOH voorgesteld kunnen worden. Zij verschillen dus in de groep R.
Een belangrijk γ-aminozuur (toevallig ook ω-aminozuur) is GABA
[bewerk] Eigenschappen van in de natuur voorkomende α-aminozuren
[bewerk] Voorkomen
Bij normale omstandigheden (25°C, P=1bar) zijn α-aminozuren in oplossing neutraal geladen als de zuurgraad (pH) gelijk is aan het isoelektrisch punt :
H2N-CH2COOH ↔ NH3+-CH2COO-
Als het aminozuur in de volgende vorm voorkomt: NH3+-CH2COO- spreekt men van een zwitterion, Het aminozuur is evenveel positief als negatief geladen.
Bij een pH lager dan het isoelektrisch punt (zuurder) dan komt het aminozuur als volgt voor: NH3+-CH2COOH.
Bij een pH hoger dan het isoelektrisch punt (basischer) dan komt het aminozuur als volgt voor: NH2-CH2COO-.
[bewerk] Optische activiteit
Alle α-aminozuren (behalve glycine) hebben een asymmetrisch koolstofatoom (chiraal koolstofatoom). Dit betekent dat deze aminozuren in twee vormen (isomeren) kunnen voor komen, de L-vorm en de D-vorm, deze twee vormen zijn het spiegelbeeld van elkaar (zie optische isomerie). De natuurlijke aminozuren komen in de L-vorm voor.
Deze twee isomeren hebben de eigenschap dat zij het polarisatievlak van gepolariseerd licht over een bepaalde hoek kunnen draaien. De L-vorm geeft een draaiing naar links, tegen de wijzers van de klok in. De hoek α waarover het polarisatievlak gedraaid wordt hangt af van het soort molecuul, concentratie, temperatuur en de afstand die het gepolariseerde licht door de oplossing aflegd.
In deze formule is : de specifieke rotatie in ml/m.g, l de afstand die het gepolariseerde licht door de oplossing aflegd in meter en c de concentratie in gram/ml.
Naam | Ontledingstemperatuur | Oplosbaarheid in water | Zuurconstanten | Isoelektrisch punt | moleculaire massa | |||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
(in °C) | (in g/100 ml bij 25°C) | pK1 | pK2 | pK3 | pH | in g/mol | ||
Alanine | 297 | 16,7 | 8,5 | 2,35 | 9,87 | 6,11 | 89 | |
Arginine | 244 | 15 | 12,5 | 1,82 | 8,99 | 13,20 | 10,76 | 174 |
Asparagine | 234 | 3,5 | -5,4 | 2,02 | 8,80 | 5,41 | 132 | |
Asparaginezuur | 270 | 0,54 | 25,0 | 1,99 | 3,90 | 10,00 | 2,98 | 133 |
Cysteïne | 121 | 16,0 | 6,5 | 1,86 | 8,35 | 10,34 | 5,02 | 121 |
Glutamine | 185 | 3,7 | 6,1 | 2,17 | 9,13 | 5.65 | 146 | |
Glutaminezuur | 247 | 0,86 | 31,4 | 2,13 | 4,32 | 9,95 | 3,08 | 147 |
Glycine | 233 | 25 | 2,35 | 9,78 | 6,06 | 75 | ||
Histidine | 287 | 4,2 | -39,7 | 1,81 | 6,05 | 9,15 | 7,64 | 155 |
Isoleucine | 284 | 4,1 | 11,3 | 2,32 | 9,76 | 6,04 | 131 | |
Leucine | 293 | 2,4 | -10,8 | 2,33 | 9,74 | 6,04 | 131 | |
Lysine | 225 | erg oplosbaar | 14,6 | 2,16 | 9,20 | 10,80 | 9,47 | 146 |
Methionine | 280 | 3,4 | -8,2 | 2,17 | 9,27 | 5,74 | 149 | |
Fenylalanine | 283 | 3,0 | -35,1 | 2,58 | 9,24 | 5,91 | 165 | |
Proline | 220 | 162 | -85,0 | 1,95 | 10,64 | 6,30 | 115 | |
Serine | 228 | 5,0 | -6,8 | 2,19 | 9,44 | 5,68 | 105 | |
Threonine | 225 | erg oplosbaar | -28,3 | 2,09 | 9,10 | 5,60 | 119 | |
Tryptofaan | 289 | 1,1 | -31,5 | 2,43 | 9,44 | 5,88 | 204 | |
Tyrosine | 342 | 0,04 | -10,6 | 2,20 | 9,11 | 10,07 | 5,63 | 181 |
Valine | 315 | 8,9 | 13,9 | 2,29 | 9,72 | 6,00 | 117 |
[bewerk] Oplosbaarheid
De oplosbaarheid hangt voornamelijk af van de polariteit van de zijketen (-R) van het α-aminozuur af. Hierdoor kan het α-aminozuur in meer of mindere mate hydrofiel dan wel hydrofoob zijn.
Dit beïnvloedt hun interactie met andere structuren, zowel binnen een eiwit zelf als wel met andere eiwitten. De verdeling van hydrofiele en hydrofobe α-aminozuren in een eiwit bepaald de tertiaire structuur van het eiwit, en de plaats van de α-aminozuren aan de buitenkant van het eiwit beïnvloedt de quaternaire structuur.
Bijvoorbeeld, oplosbare eiwitten hebben een oppervlak dat rijk is aan polaire aminozuren zoals serine en threonine, terwijl membraaneiwitten aan de buitenkant hydrofobe aminozuren hebben die zich hechten aan een lipidemembraan.
Zo hebben eiwitten, die positief geladen moleculen moeten binden, veel negatief geladen α-aminozuren, zoals glutaminezuur en asparaginezuur, aan de buitenkant, en hebben eiwitten die negatief geladen moleculen moeten binden een oppervlak dat rijk is aan lysine en arginine.
Hydrofiele en hydrofobe interacties van de eiwitten hoeven niet af te hangen van de zijketens (-R) van de α-aminozuren. Er kunnen andere ketens aan het eiwit gehecht worden en zo hydrofobe lipoproteïnen of hydrofobe glycoproteïnen vormen.
[bewerk] Synthese van eiwitten
Ribosomen lezen mRNA af en bouwen aan de hand daarvan een polypeptide of eiwit. Dit proces heet translatie. Het tRNA (transport RNA) zorgt voor de aanvoer van aminozuren naar het ribosoom toe die deze omzet in een polypeptide of eiwit.
mRNA bestaat uit een sequentie van basen, welke per drietal (codon) coderen voor een specifiek aminozuur. Zo zal de sequentie ACC en ACA resulteren in de aankoppeling van een threoninemolecuul aan het polypeptide.
[bewerk] Aandoeningen
Mensen die lijden aan fenylketonurie kunnen geen fenylalanine afbreken en omzetten in tyrosine en moeten dit dus met het voedsel binnen krijgen. Doordat het fenylalanine zich in het bloed en de ruggenmerg ophoopt, kunnen er op termijn ernstige lichamelijke problemen optreden. Daarom wordt er bij pasgeborenen met een hielprik bloed afgenomen en worden zij op deze afwijking gecontroleerd. Met een dieet zijn ernstige problemen redelijk te voorkomen.
[bewerk] Zie ook
[bewerk] Externe links
- (en) (de) Chemische stucturen van aminozuren
- (en) (pl) On-line berekenen van het iso-elektrisch punt van aminozuren
Bronnen, noten en/of referenties: |
|