胚珠（はいしゅ）とは種子植物の種子になる部分である。卵細胞を内蔵し、受粉の時は花粉から花粉管が胚珠の内部へと伸び、花粉内部の精細胞が胚珠内部の卵細胞と受精する。
被子植物では、胚珠には、胚のう母細胞が入っており、これが減数分裂によって４つの細胞になるが、１つだけが残って胚のう細胞となる。胚のう細胞は分裂によって数個の核を含む胚のうとなり、そのうちの１つが卵細胞になる。
受精の後、受精卵は発生をはじめ、幼い植物がある程度形を取って胚珠の皮（珠皮）の中で発達する。成熟すれば胚珠は種子となり、珠皮は種皮になる。
被子植物では胚珠は雌しべの根本の子房というふくらんだ部分の中にある。子房には中に空間があり、そこに胚珠がはいっている。胚珠が種子として成熟したときは、子房は果実となる。
裸子植物の場合は、胚珠はむき出しになって雌しべの上にならんでいる。実際には、多くの場合、雌しべ同士が密着して、胚珠が外からは見えないようになっている。
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