マノクワリ (Manokwari) はインドネシア西イリアンジャヤ州の都市及び県 (Kabupaten) の名前（「古い村」を意味する。）であり、ニューギニア島の西端にあたる。2003年2月に西イリアンジャヤ州がパプア州から分離したことに伴い、州都となった。マノクワリ県全体の面積は18,746km²であり、人口は167,035人（インドネシア統計庁の2005年推計）、そのうちマノクワリ市には約53,000人（ドイツ語版）が住んでいる。
マノクワリは、太平洋戦争時に大日本帝国海軍の艦船が多く寄港した。マクノワリ近海には白露型駆逐艦である春雨が沈没している。
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