Short hairpin RNA
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Uno short hairpin RNA (traducibile come breve RNA a forcina), comunemente abbreviato come shRNA, è una sequenza di RNA che, curvandosi, forma una struttura che ricorda una forcina. Viene solitamente utilizzato per il silenziamento dell'espressione genica attraverso l'attivazione della RNA interference.
[modifica] Meccanismo d'azione
I vettori (ad esempio plasmidi) predisposti per il silenziamento genico contengono sequenze di shRNA trascrivibili attraverso la RNA polimerasi III. La produzione di shRNA nelle cellule di mammifero possono indurre a volte la produzione di interferone, dal momento che le cellule interpretano la presenza di shRNA come la presenza di particelle virali. Questo problema non si riscontra invece per quanto riguarda i microRNA, trascritti dalla RNA polimerasi II (la stessa utilizzata per trascrivere gli mRNA). Gli shRNA trascritti, in ogni caso, vengono processati probabilmente da una RNAsi specifica, dicer, che produce gli siRNA effettivamente in grado di attivare la RNAi.
[modifica] Bibliografia
- (EN) McIntyre G et al, Design and cloning strategies for constructing shRNA expression vectors, BMC Biotechnol. 2006; 6: 1
- (EN) Harper SQ et al, RNA interference improves motor and neuropathological abnormalities in a Huntington's disease mouse model, Proc Natl Acad Sci U S A. 2005 April 19; 102(16): 5820–5825
- (EN) Nielsen MH et al, Molecular strategies to inhibit HIV-1 replication, Retrovirology. 2005; 2: 10
- (EN) Paddison PJ et al, Short hairpin RNAs (shRNAs) induce sequence-specific silencing in mammalian cells, Genes and development, 16, 8, 948-958, April 15, 2002
- (EN) Cao W et al, DNA constructs designed to produce short hairpin, interfering RNAs in transgenic mice sometimes show early lethality and an interferon response, J Appl Genet 46(2), 2005, pp. 217-225
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| Basi azotate | Adenina • Timina • Uracile • Guanina • Citosina • Purina • Pirimidina |
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| Nucleosidi | Adenosina • Uridina • Guanosina • Citidina • Deossiadenosina • Timidina • Deossiguanosina • Deossicitidina | |
| Nucleotidi | AMP • UMP • GMP • CMP • ADP • UDP • GDP • CDP • ATP • UTP • GTP • CTP • cAMP • cADPR • cGMP | |
| Deossinucleotidi | dAMP • dTMP • dGMP • dCMP • dADP • dTDP • dGDP • dCDP • dATP • dTTP • dGTP • dCTP | |
| Acidi ribonucleici | RNA • mRNA • tRNA • rRNA • hnRNA • ncRNA • sgRNA • shRNA • siRNA • snRNA • miRNA • piRNA • snoRNA | |
| Acidi nucleici | DNA • mtDNA • cDNA • plasmide • cosmide • BAC • YAC • HAC | |
| Analoghi degli acidi nucleici | GNA • LNA • PNA • TNA • Morfolino | |
