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BSA (Bulked-Segregant Analysis) – Wikipedia

BSA (Bulked-Segregant Analysis)

aus Wikipedia, der freien Enzyklopädie

 

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BSA (bulked segregated analysis): Einer von verschiedenen Ansätzen um mit Genen gekoppelte Marker für die Kartierung von Genomen zu identifizieren.

Die Vertreter einer Population teilt man verschiedenen Pools zu anhand der unterschiedlichen phänotypischen Ausprägung eines betrachteten Merkmals. Hierbei werden immer Extreme miteinander verglichen (z.B Schosse/Nicht-Schosser).

Innerhalb jedes Pools ist die für den Phänotyp verantwortliche Gensequenz der einzelnen Individuen identisch, der Aufbau des restlichen Genoms ist zufällig (Randomisierter Hintergrund, statistisch KEIN Unterschied zwischen den Pools). Ebenso kann man aufgrund der phänotypischen Unterschiede zwischen den Pools davon ausgehen, dass die das Merkmal betreffenden Region auf dem Genom zwischen den Pools verschiedenartig ist. Unterschiede also nur bei der Region, die für den betrachteten Phänotyp verantwortlich ist, der Rest ist zufällig verteilt und hebt sich gegenseitig auf.

Die so gefundenen Marker sind eng mit dem Gen gekoppelt und häufig bereits hinsichtlich ihrer Position auf der genetischen Karte bekannt, sodass es möglich ist mit ihnen als Sonde auf den Inserts der BACs einer Bibliothek nach dem Gen zu suchen (z.B nach dem Schossergen).


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