核糖體RNA
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核糖體RNA（ribosomal RNA, rRNA）是生物體中核糖核酸（RNA）的一類，為核糖體（ribosome）的主要部份，功能為提供一個環境能使tRNA對應到mRNA上的密碼子，而合成蛋白質。其中核糖體大亞基（large subunit, LSU）具有一或兩個rRNA分子（多數原核生物爲23S和5S，真核生物爲28S和5.8S），小亞基（small subunit, SSU）具有一个rRNA分子（多數原核生物爲16S，真核生物爲18S）。
在近年的系統發育樹中，核糖體RNA序列，尤其是小亞基RNA（SSU rRNA）成爲最常用的做樹依據，因爲SSU rRNA具有以下特點：
- 長度適中，通常1200～1900bp，能夠提供足夠的信息，但又不過長。
- 完全廣泛分佈于所有生物，而且具有相對緩慢的進化過程。其中保守區可用於構建所有生命的大一統進化樹，而易變的區域可用來區別屬或者種。
- 所有的rRNA都是功能上和序列上同源的，且一個生物細胞中的rRNA序列完全一致或極少差別（除葉綠體和線粒體等和極少數例外情況）。
- rRNA基因的水平轉移非常難發生，因爲它們的功能太基本且重要，需要翻譯機制的精細調控才能夠正常實現功能。
| 主要生物化学物质种类 | ||
| 肽 | 氨基酸 | 核酸 | 糖类 | 核苷糖 | 脂類 | 萜类 | 类胡萝卜素 | 四吡咯 | 辅因子 | 类固醇 | 类黄酮 | 生物碱 | 聚酮 | 配糖类 | ||
| Analogues of nucleic acids: | 核酸類型 | Analogues of nucleic acids: |
| 鹼基： | 嘌呤（腺嘌呤/鳥嘌呤） | 嘧啶（尿嘧啶/胸腺嘧啶/胞嘧啶） | |
|---|---|---|
| 核苷： | 腺苷/去氧腺苷 | 鳥苷/去氧鳥苷 | 尿苷 | 胸苷 | 胞苷/去氧胞苷 | |
| 核苷酸： | AMP/UMP/GMP/CMP | ADP/UDP/GDP/CDP | ATP/UTP/GTP/CTP | cAMP/cGMP/cADPR | |
| 去氧核苷酸： | dAMP/TMP/dGMP/dCMP | dADP/TDP/dGDP/dCDP | dATP/TTP/dGTP/dCTP | |
| 核糖核酸： | RNA | mRNA | piRNA | tRNA | rRNA | ncRNA | gRNA | shRNA | siRNA | snRNA | miRNA | snoRNA | |
| 去氧核糖核酸： | DNA | mtDNA | cDNA | 質體 | 黏質體 | BAC | YAC | HAC | |
| 核酸相似物： | GNA | PNA | TNA | LNA | Morpholino | |
