IRES

Материал из Википедии — свободной энциклопедии

IRES — участок внутренней посадки рибосомы (русская аббревиатура практически не используется, более распространена англоязычная IRES от Internal Ribosome Entry Site) — последовательность нуклеотидов в эукариотических мРНК, обеспечивающая инициацию трансляции без сканирования большей части 5'-нетранслируемой области, как это имеет место в большинстве клеточных мРНК.

Участки внутренней посадки рибосомы были открыты в мРНК полиовируса в 1986 году группами Н.Соненберга и Э.Виммера. Оказалось, что если поместить IRES между двумя репортерными генами в мРНК, то второй (3'-концевой) цистрон также будет экспрессироваться. Однако использование данного метода (т. н. метода бицистронныых конструкций) может привести к ряду артефактов, связанных со сплайсингом и нахождением в изучаемой последовательности промоторной активности. См. [1].

IRESы обнаружены в 5'-нетранслируемых областях геномных мРНК вирусов и позволяют им транслироваться независимо от кэпа. Предполагается, что ряд клеточных мРНК также может содержать IRESы, однако этот вопрос является дискуссионным и на этот счет существуют большие сомнения. К ноябрю 2005 года было известно около 50 содержащих IRESы вирусов и около 73 мРНК [2].

В отличие от клеточных IRESов, существование вирусных IRESов не вызывает никаких сомнений. Следует иметь в виду, что многие вирусные мРНК имеют на своём 5'-конце ковалентно связанный белок (VpG), поэтому использование кэп-зависимой инициации для них исключено. Более того, ряд их был изучен весьма подробно. Так было показано, что IRESы группы вируса гепатита С связывают 40S рибосомную субчастицу таким образом, что инициаторных кодон мРНК оказывается непосредственно в Р-участке рибосомы без какого-либо сканирования мРНК. IRESы многих пикорнавирусов не связывают 40S напрямую, а делают это через фактор инициации 4G, высокоафинный сайт связывания которого находится в IRESе [3].