SMILES
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La nomenclatura SMILES (del inglés; Simplified Molecular Input Line Entry Specification), es una manera de representar la estructura química usando cadenas de caracteres alfanuméricos de tipo ASCII.
Por ejemplo, La representación del ácido tartárico en SMILES es: [C@2H]([OH])([C@2H]([OH])[C](=[O])[O-])[C](=[O])[OH]
Ejemplo de moléculas de enlacs simples:
- C representa el metano (CH4)
- O representa el agua (H2O)
- CCO representa el etanol (CH3CH2OH)
- CC(C)C representa el 2-butano (CH3CH(CH3)CH3)
Enlaces dobles(=) y triples(#);
- O=C=O representa el dioxido de carbono (CO2)
- C#C representa el grupo acetileno (HC≡CH)
- CC(=O)O representa el ácido acético (CH3COOH)
Hidrocarburos cíclicos;
- C1CC1 representa al ciclopropano
- c1ccccc1 representa al benceno
[editar] Referencias
- Anderson, E., G.D. Veith, and D. Weininger. 1987. SMILES: A line notation and computerized interpreter for chemical structures. Report No. EPA/600/M-87/021. U.S. EPA, Environmental Research Laboratory-Duluth, Duluth, MN 55804
- Weininger, D. (1988), 'SMILES, a chemical language and information system. 1. Introduction to methodology and encoding rules', J. Chem. Inf. Comput. Sci. 28, 31 - 36.
- Helson, HE (1999). Structure Diagram Generation In Rev. Comput. Chem. edited by Lipkowitz, K. B. and Boyd, D. B. Wiley-VCH, New York, pages 313-398.
[editar] Enlaces externos
- Tutorial sobre SMILES (en inglés)
- Página web capaz de generar gráficos en 2D a partir de una cadena SMILES
- Applet de edición de moléculas que generan cadenas SMILES
- Procesamiento de SMILES
- E-BABEL Conversión interactiva de moléculas en el WWW basado en OpenBabel
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