Diskussion:BLAST-Algorithmus

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Dieser Artikel beschreibt nicht den BLAST-Algorithmus, sonder die daraus entstandenen BLAST-Tools! Der Algorithmus wird beschrieben durch Seeding, Stitching, Berechnung der Signifikanz durch Karlin Altschul Statistiken und Extremwertverteilung!

wie ist die Schreibweise: BLAST-Algorithmus oder Blast Algorithmus? --chd 00:18, 29. Mai 2003 (CEST)

Soweit ich weiß ist BLAST korrekt --Urbanus 02:04, 29. Mai 2003 (CEST)

BLAST ist korrekt, (steht auch im angegebenen Paper) immerhin handelt es sich dabei um eine Abkürzung. Artikel wird grad grundsätzlich überarbeitet, bitte nicht wundern! Dante hd 10:06, 21. Jan 2006 (CET)

Blast ermöglicht nicht wirklich eine unscharfe Mustererkennung. Query und Target werden in kleine Blöcke unterteilt (z. B. 3 bei AS, 11 bei Nukleotiden). Zwischen diesen Blöcken werden Übereinstimmungen gesucht, die dann verlängert werden. Ob das eine unscharfe Mustererkennung ermöglicht bezweifel ich.

Doch unscharfe Erkennung ist möglich da ja BLAST und FASTA auf Sequenzalignment beruhen, d.h. Fehler in den Sequenzen werden toleriert, verschlechtern aber den Score.

Unscharf schon, Mustererkennung ist aber etwas anderes.