بروتين
من ويكيبيديا، الموسوعة الحرة
البروتين أو الهَيُولِين غذاء معقّد التركيب عضوي ذو وزن جزيئي عالي يتكون من أحماض أمينية مرتبطة مع بعضها بواسطة رابطة ببتيدية. البروتين ضروري في تركيب ووظيفة كلّ الخلايا الحية وحتى الفيروسات.
العديد من البروتينات تشكل الانزيمات أَو وحدات بروتينية تدخل في تركيب الإنزيماتِ. كما يقوم البروتين بأدوار أخرى الهيكليةِ أَو الميكانيكيةِ، مثل تلك تشكيل الدعاماتَ و المفاصلَ ضمن الهيكل الخلوي . تلعب البروتينات مهام حيوية اخرى فهي عضو مهم في الإستجابة المناعية و في تخزين و نقل الجزيئات الحيوية كما تشكل مصدرا للحموض الأمينية بالنسبة للكائنات التي لا تستطيع تشكيل هذه الحموض الأمينية بنفسها .
البروتينات أيضا واحدة من الجزيئات الضخمة الحيوية إلى جانب عديدات السكريدات و الدسم و الأحماض النووية، وهذه الجريئات الضخمة الحيوية تشكل بمجموعها مكونات المادة الحية الأساسية .
فهرس |
[تحرير] بنية البروتين
يتألف البروتين من سلاسل ببتيدية مؤلفة من ترابط حموض نووية تلتف فيما بعد لتشكل بنية ثلاثية الأبعاد فريدة ( يتميز كل بروتين ببنية مختلفة عن البروتينات الأخرى ، تدعى هذه البنية بالحالة الأصلية للبروتين و تتحدد حسب ترتيب الحموض الأمينية في عملية الترابط التي تشكل السلاسل البروتينية .
- بنية أولية: تحددها تسلسل الحموض الأمينية
- بنية ثانوية: تتألف من بنى ثانوية تتشكل من التفاف السلاسل الببتيدية على بعضها بشكل حلزونات ألفا و صفائح بيتا .
- بنية ثالثية: وهي ما يحدد شكل البروتين النهائي ، تتألف من اجتماع البنى الثانوية للبروتين ( لوالب ألفا و صفائح بيتا ) بوساطة قوى فيزيائية غير تكافؤية لتعطي الشكل النهائي للبروتين
- بنية رابعية: يستخدم عادة هذا المصطلح للدلالة على البنية التي تكونها اتحاد بروتينين أو أكثر في ما يسمى الوحدة البروتينية .
البنية البروتينية غير ثابتة اطلاقا بل تتغير لتأدية وظائفها المختلفة و لتحقيق هذا التغيير البنيوي يحدث تغير في ارتباطات البنية الثالثية و الرابعية ، لذلك ندعو هذه البنى الثالثية و الرابعية تشكيلات كيميائية و ما يحدث لها من تغيرات بالتغيرات التشكيلية conformational changes .
[تحرير] الوظائف
يشارك البروتين تقريبا في جميع العمليات الخلوية بما فيها تنظيم الوظائف الخلوية مثل نقل الإشارات الخلوية و الاستقلاب فعملية تحطيم البروتينات نفسها تجري في الخلية بالإستعانة بأنزيمات ( و هي مركبات بروتينية ) تدعى بروتيازات .
[تحرير] آلية التنظيم البروتيني
يمكن للبروتينات ان تربط بها جزيئات كيماوية متنوعة و شوارد معدنية ضمن تجويفات خاصة في بنيتها تدعى : مواقع الإرتباط Bindingsites ومع ذلك تتميز البروتينات باصطفائية كيميائية عالية تجاه المركبات التي ترتبط بها . تدعى المركبات التي ترتبط بالبروتينات لجينات ligand ، أما شدة الارتباط لجين-بروتين فهي إحدى خصائص موقع الارتباط و تدعى الألفة affinity .
بما أن البروتينات تتدخل في كل عملية تتم ضمن الخلايا الحية ، لذلك فإن التحكم في العمليات الحيوية يمكن ان يتم عن طريق التحكم بفعالية هذه البروتينات . هذا التنظيم لمل البروتينات يمكن أن يتم عن طريق شكل البروتينات أو تركيزها :
- تحوير تفارغي Allosteric modulation
- تحوير تساهمي Covalent modulation .
[تحرير] ما المركبات الرئيسية التي تسهم في تركيب البروتين
تساهم في عملية تركيب البروتينات في الخلية الحية المركبات الآتية: حمض(DNA)-حمض (RNA)المرسال-حمض(RNA)الناقل-الريباسات
نسخ المادة الوراثية لا تتحول المعلومات الوراثية في المورثات إلى بروتينات مباشرة حيث تقوم المورثة بنسخ ال(RNA)المرسال الخاص بها حاملا إلى الهيولى رسالة المورثة التي يعبر عنها بلغة النوكليوتيدات بالاتجاه(5َ إلى 3َ)على ال(RNA) المرسال لذلك تدعى سلسة(DNA) المورثة السلسلة الناسخة أو المشفرة.
[تحرير] انظر أيضا
- بريون
- بروتينويد = شبيه البروتين
- بروتيوم
- ريبوزوم
- علم الجينوم البنيوي Structural genomics .
- قائمة البروتينات
[تحرير] وصلات خارجية
- Proteins (the journal), also called "Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics" and previously "Proteins: Structure, Function, and Genetics" (1986-1995).
[تحرير] مشاريع و قواعد بيانات
- بنك بيانات البروتينات
- UniProt مصدر معلومات البروتينات العالمي
- أطلس البروتينات البشرية
- iHOP - روابط معلومات حول البروتينات
- البروتينات: من التشكيل الحيوي إلى التفكك - المكتبة الافتراضية للكيمياء الحيوية و البيولوجيا الجزيئية
- MIT's Laboratory for Protein Molecular Self-Assembly
- Numerous publications on synthetic biomimetic protein-based biomaterials
- Amino acid metabolism
- صور البروتنيات
- برنامج لرؤية ملفات PDB على النت مباشرة
[تحرير] مواقع تعليمية
- Proteins: Biogenesis to Degradation - The Virtual Library of Biochemistry and Cell Biology
- Amino acid metabolism
- Data Book of Molecules - Home Page for Learning Environmental Chemistry
البروتينات |
---|
تصنيع البروتينات الحيوي • تعديلات ما بعد-الترجمة • طي البروتين • بنية البروتين • نطاقات بنية البروتين • استهداف البروتين • بروتيوزوم • قائمة البروتينات • (بروتينات غشائية • بروتينات كروية • بروتينات فبرية) • قائمة أنماط البروتينات • بروتيوم • طرائق البحث في البروتين |
|
|
---|---|
أليفاتية | فالين | إيزوليوسين | ليوسين | ميثيونين | ألانين | برولين | غلايسين |
أروماتية | فينيل ألانين | تايروزين | تريبتوفان | هستدين |
قطبي ، غير مشحون | أسبارجينين | غلوتامين | سيرين | تيريونين |
شحنة موجبة (pKa) | لايزين (?10.8) | أرجنين (≈12.5) | هستدين (≈6.1) |
شحنة سالبة (pKa) | حمض الأسبارتيك (≈3.9) | حمض الغلوتاميك (≈4.1) | سيستين (≈8.3) | تايروزين (≈10.1) |
مواضيع عامة | حمض اميني أساسي | بروتين | ببتيد | شفرة جينية |
البنية الأولية← |
قالب:ببتيدات
|
|
---|---|
نجريبية | تنقية البروتين - بروتين متألق أخضر - لطخة غربية - الصبغ المناعي للبروتين - سلسلة البروتين - رحلان كهربائي بالهلام/رحلان كهربائي للبروتين - ترسيب مناعي - بصمة-أصابع كتلة البيبتيد |
معلوماتية حيوية | التنبؤ ببنية البروتين - إرساء البروتين-بروتين - تراصف البروتين البنيوي - علم وجود البروتين - التنبؤ يتآثرات بروتين-بروتين |
معايرة | معايرة الإنزيم - معايرة البروتين - معايرة الإفراز |
|
|
---|---|
مواضيع | موقع فعال - موقع رابط - إنزيم كامل تحفيزيا - مرافق إنزيم - عامل مرافق - عدد EC - تحفيز إنزيمي - حركيات الإنزيم - مثبط إنزيمي - لطخة لاينويفر-بورك - حركيات ميكايليس-مينتن |
أنماط | EC1 أوكسيدوريدوكتاز/قائمة - EC2 ترانسفيراز/قائمة - EC3 هيدرولاز/قائمة - EC4 لياز/قائمة - EC5 إيزوميراز/قائمة - EC6 ليغاز/قائمة |
|
|
---|---|
خييطات دقيقة | أكتينات - بروتتينات رابطة الأكتين - أكتينين - Arp2/3 complex - كوفيلين - ديسترين - غيلسولين - ميوسين - بروفيلين - Tropomodulin - Troponin (T, C, I) - Tropomyosin - Wiskott-Aldrich syndrome protein |
خييطات وسيطة | type 1 and 2 (Cytokeratin, type I, type II) - type 3 (Desmin, GFAP, Peripherin, Vimentin) - type 4 (Internexin, Nestin, Neurofilament, Synemin, Syncoilin) - type 5 (Lamin A, B) |
نبيبات دقيقة | Dyneins - Kinesins - MAPs (Tau protein, Dynamin) - Tubulins - Stathmin |
كاتينينات | Alpha catenin - Beta catenin - Plakoglobin (gamma catenin) - Delta catenin |
لابشرية | بروتين النطفة الرئيسي - Prokaryotic cytoskeleton (Crescentin, FtsZ, MreB) |
أخرى | APC - Dystrophin (Dystroglycan) - plakin (Desmoplakin, Plectin) - Spectrin - Talin - Utrophin - Vinculin |
|
|
---|---|
عوامل التخثر | مسار داخلي (FXII, FXI, FIX, FVIII) - مسار خارجي (Tissue factor, FVII) - common pathway (FX, FV, (Pro)thrombin / FII, Fibrin / FI, FXIII) - HMWK - vWF - Kallikrein |
مثبطات | Antithrombin - Protein C - Protein S - Protein Z - ZPI - TFPI |
تحلل الفيبرين Fibrinolysis | Plasmin - tPA/urokinase - PAI-1/2 - α2-AP - α2-macroglobulin - TAFI |
|
|
---|---|
مفعلات | CLA: C3-convertase - MAC (C6, C7, C8, C9) - L: Mannan-binding lectin - A: Factor P/Properdin |
إنزيمات | C: C1Q/C1R/C1S - C4 - C2 - CLA: C3 - C5 (C5a) - L: MASP1 - MASP2 - A: Factor B - Factor D |
مثبطات | CLA: C1-inhibitor - Decay accelerating factor - Factor I - CL: C4BP - A: Factor H |
مستقبلات تكميلية | CR1 - CR2 - CR3 - CR4 - CD11b/CD11c/CD18 - C3a receptor - C5a receptor |
|
|
---|---|
هرمونات | Follistatin - Growth hormone binding protein - Insulin-like growth factor binding protein - Neurophysins (Neurophysin I, II) Sex hormone binding globulin/Androgen binding protein - Transcortin - Thyroxine-binding globulin - Transthyretin |
معادن | calcium (Calcium-binding protein, Calmodulin-binding proteins) - copper (Ceruloplasmin) - iron (Iron-binding proteins, Transferrin receptor) |
فيتامينات | بروتين رابط للريتينول - ترانسكوبولامين |
أخرى | Acyl carrier protein - Adaptor protein - Cholesterylester transfer protein - F-box protein - GTP-binding protein - Latent TGF-beta binding protein - Light-harvesting complex - Membrane transport protein |
كيمياء غذائية |
---|
كربوهيدرات • ملونات • إنزيمات • نكهات • إضافات غذائية • دسم • معادن • بروتينات • فيتامينات • ماء |
|
|
---|---|
تخليق البروتين الحيوي - تخليق الحموض الأمينية - استقلاب البروتين التحطيمي استقلاب النيكليوتيدات: استقلاب البورين - Nucleotide salvage - استقلاب البريميدين |
|
|
---|---|
الكولاجين | Type-I (COL1A1) - Type-II (COL2A1) - Type-III - Type-IV - Type-V - Type XI (COL11A2) - Type-XVII - Type-XVIII |
كيراتين/سيتوكيراتين | type I (10, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21), type II (1, 2A, 3, 4, 5, 6A, 7, 8, 9), Hair (Type I, Type II), Beta |
اخرى | إيلاستين - الهيكل الخلوي |
|
|
---|---|
animal | Calnexin - Calreticulin - CD22 - CD33 - Galectin - Myelin-associated glycoprotein - N-Acetylglucosamine receptor - Selectin - Sialoadhesin |
animal, calcium-dependent | Aggrecan - Asialoglycoprotein receptor - CD94 - Collectin (Mannan-binding lectin) - Mannose receptor - Versican |
plant | Abrin - Ricin - Mitogens (Concanavalin A, Phytohaemagglutinin, Pokeweed mitogen) |
غلوبيولينات | بروتينات :
---|
لاكتوغلوبيولين (لاكتوفيرين) -
ثيروغلوبيولين Thyroglobulin المصل الدموي: ألفا غلوبيولين - بيتا غلوبيولين - غاما غلوبيولين (غلوبيولينات مناعية) - فيبرونيكتين - ماكروغلوبيولين - ترانسكوبولامين |
قالب:ألبومينات
|
|
---|---|
Ankyrin - Arrestin - Calnexin - Connexin - Dystrophin - Ephrin - Heterotrimeric GTP-binding proteins - LDL-receptor-related protein associated protein - Membrane fusion protein (VAMP) - Membrane glycoproteins - Membrane transport proteins - Myelin basic protein - Neurofibromin 2 - Phospholipid transfer proteins - Pore forming toxins - Presenilin - Protoporphyrinogen oxidase - Pulmonary surfactant-associated protein B - Pulmonary surfactant-associated protein C - Spectrin - Tetraspanin - Transmembrane receptors - Utrophin - Vesicular transport proteins |
قالب:فلافوبروتينات قالب:غليكوبروتينات
|
|
---|---|
سايكلين | A - B - D - E |
كيناز معتمد على السايكلين | 2 - 4 - 6 - 9 - CDK-activating kinase |
بروتينات مثبطة للكيناز المعتمد على السايكلين | p14arf/p16INK4a - p21 - p27 - p57 |
مواضيع اخرى | Cdc2 - Cdc25 - Cdc42 - Cellular apoptosis susceptibility protein - E2F - Maturation promoting factor - Wee |
|
|
---|---|
Angiopoietin - Angiostatin - Endostatin - Vascular endothelial growth factor |