目前寡孢根黴菌（Rhizopus oligosporus）的分類地位如下：
真菌界（Kingdom Fungi）
接合菌門 （Phylum Zygomycota）
接合菌綱 （Class Zygomycetes）
毛黴目 （Order Mucorales）
毛黴科 （Family Mucoraceae）
根黴屬 （Genus Rhizopus）
小孢根黴菌群 （Group Rhizopus microsporus）
學名：Rhizopus microsporus var. oligosporus (Saito) Schipper & Stalpers
原名（Basionym）：Rhizopus oligosporus Saito
寡孢根黴菌為製作丹貝的主要菌種。
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